Tout dépend de ce que tu veux faire, je vais supposer que c'est pour un pc de jeux ; dans ce cas, ça dépend de ton boîtier et de ton budget.

Les cartes mATX coûtent moins chères car elles ont moins de matières et moins de fonctionnalités, notamment au niveau des ports d'extensions, sauf que pour du gaming, tu n'as pas vraiment besoin d'une ATX, même les 4 slots de ram qu'on te met sur une mATX sont inutiles car tu vas en utiliser que 2 généralement.

Le problème, si tu mets une carte mATX dans un boîtier moyenne/grande tour, bah tu vas avoir beaucoup de mal à refroidir la carte graphique qui va se retrouver avec beaucoup d'espace mais peu d'accès à de l'air frais, si tu pars sur une mATX, je te conseille donc d'acheter un boîtier prévu pour ce format, histoire de pas avoir trop de problèmes, tu peux regarder le "LianLi Dan Case A3" par exemple.

Je fais une parenthèse sur les cartes miniITX, encore plus petite, qui pour le coup sont le seul moyen d'avoir un boîtier mini tour, n'ont pas de problème de fonctionnalités, mais coûtent plus chères à cause des micro-conducteurs, certaines c'est plus de 300 euros la carte, ça commence à faire beaucoup pour un composant nécessaire mais pas si utile que ça pour le commun des mortels.