En 2000, Prevost autorisa le père James Ray, prêtre augustinien, à résider au couvent St. John Stone de Chicago. Ray était suspendu de tout ministère public depuis 1991 en raison d'accusations crédibles d'abus sexuels sur mineurs. Bien que le prieuré fût proche d'une école primaire catholique, Prevost n'en informa pas l'administration. Les Augustins notèrent que Ray avait été placé sous surveillance pendant son séjour à St. John Stone. Ray fut muté dans une autre résidence en 2002, lorsque la Conférence des évêques catholiques des États-Unis adopta des règles plus strictes pour le traitement des prêtres accusés d'abus sexuels sur mineurs