Rappel :

L'alchimie est apparue au temps de l'empire égyptien dans les forges qui étaient considérées comme des endroits magiques où la matière pouvait changer de forme et même de nature (alliage), ceux qui maitrisaient cet art (forgerons) étaient vus comme des prêtres

Avec le temps la pratique a aussi finie par désigner la transformation intérieure des individus, très courante au premiers temps du christianisme, elle s'est ensuite diffusé dans tout l'occident via le peuple j qui est depuis longtemps à l'avant garde dans ce domaine (notamment grace à l'étude du talmud) :

Dans l'univers de yu gi oh il existe 7 objets (métalliques) du "millenium", chacun permet d'accéder à des pouvoirs spécifiques, le héros a reçu le puzzle du millenium qui ressemble étrangement à un symbole des rose-croix :

Les rose-croix sont une société secrète qui prétend entretenir la lignée royale de Jésus Christ (issue de la lignée de David et Salomon), lignée qui a donnée plus tard en France la lignée des rois Mérovingiens, France pays d'ou vient Maximilien Pegasus le créateur du duel de monstres

Le héros est un personnage chétif qui possède le puzzle du millénium, le puzzle est habité par une entité qui est en fait la meilleure version de lui même, ce qu'il va tenter de devenir tout à long de l'aventure (c'est le but de l'alchimiste qui appelle ça "transmuter"), il s'agit donc d'une initiation déguisée que le spectateur va vivre par procuration

Le duel de monstre est une allégorie de l'existence dans la réalité, c'est la composition du deck et la manière dont il est utilisé qui va déterminer l'issu des confrontations entre les protagonistes

La série insiste beaucoup sur la confiance en la composition de son deck, "croire en l'âme des cartes", il s'agit en fait de construction intérieure avec des valeurs solides qui permettront d'affronter la vie sereinement, le deck de cartes est d'une certaine manière les ressources spirituelles du joueur lui même qu'il peut invoquer pour accomplir ses taches

Quelle partie ?

Pégasus ne vient pas de France, il est américain

dans le manga son prénom c'est "Pegasus" et son nom de famille "Crawford".

Sinon c'est normal qu'il y ait énormément de symbologie ésotérique étant donné que le manga parle de magie noire, d'esprits maléfiques et que le héros est littéralement possédé par un pharaon expert du jeu, et que beaucoup de monstres sont des démons ou des magiciens.

mais j'avais vu plusieurs parallèles plutot simples par rapport aux monstres:

Yugi = Kuriboh
Yami Yugi = Dark Magician
L'union des deux = Dark Chaos Magician
Kaiba = Blue Eyes White Dragon qui représente la puissance ultime
Joey / Jonouchi = Red Eyes Black Dragon qui représente le potentiel

par ailleurs que les deux principaux méchants Pegasus et Marek sont tout deux des étrangers

meme dans la saison filler de l'anime avec le sceau d'orichalque c'est aussi des étrangers.

Et Exodia alors ?

C'est un peu ça oui

D'ailleurs pour l'arc du sceau d'orichalque qui est un filler de l'anime je pense qu'ils ont essayé de parodier la version occidentale censurée de la série.
L'action se déroule principalement aux États-Unis.
Le méchant ne tue pas directement les gens, mais prend leurs âmes, comme dans le "Royaume des Ombres" qui est une invention de 4kids pour censurer la mort.
Une esthétique médiévale-fantastique occidentale et des références évidentes au Seigneur des Anneaux et à la légende Arthurienne.
Des références bibliques littérales, l'histoire parle de la fin des temps dans l'univers Yu-Gi-Oh!. Dartz est l'Antéchrist, le Sceau d'Orichalque est la Marque de la Bête, le Grand Léviathan est Satan, le dragon et la Bête de l'Apocalypse. Dartz possède également une autre puissante carte du Serpent Infini, Yami Yugi prononçant un discours chrétien sur l'amour et les souvenirs des personnes capturées à l'intérieur du Léviathan, Rafael et sa carte d'Ange.
La situation dégénère en un conflit mondial et des créatures ressemblant à des Orques sont invoquées dans toutes les villes du monde pour voler les âmes.
Références possibles à Saint Seiya avec l'esthétique grecque, l'Atlantide et les armures de combat de Valon.
Les trois dragons qui portent les noms des dialogues de Platon ou il parle de l'atlantide

Je pense que cette saison est une sorte d'hommage aux fans occidentaux.

Il est de nationalité américaine mais plusieurs indices laissent fortement penser qu'il est d'origine française (comme beaucoup d'américains très fortunés) ; il s'appelle Maximilien, il vit dans un château dans le style européen, il a des gouts très raffiné, il boit du vin, il a un coté romantique

La carte du sceau d'Orichalque fait référence à la Thelema, un mouvement occulte qui existe réellement (issu en partie du culte d'Osiris) :