Voici quelques exemples où la théorie de l'évolution a été observée directement :

L'émergence de la capacité de digérer le nylon chez les bactéries :
Une souche de bactéries Pseudomonas a évolué pour dégrader les sous-produits du nylon, un polymère synthétique inventé dans les années 1930. Ces bactéries ont développé une enzyme, la nylonase, qui n'existait pas auparavant, leur permettant d'utiliser les déchets du nylon comme source de carbone. Cela démontre l'apparition d'une nouvelle fonction métabolique.

L'évolution de la tolérance au citrate chez Escherichia coli :
Dans une expérience de longue durée dirigée par Richard Lenski depuis 1988, une population de E. coli a développé la capacité de métaboliser le citrate en présence d'oxygène après environ 31 000 générations. Cette capacité, absente dans les conditions normales de E. coli, est due à une série de mutations qui ont permis aux bactéries d'utiliser le citrate comme source de carbone.

L'apparition de nouvelles couleurs chez les cichlidés du lac Malawi :
Dans les lacs africains, les cichlidés sont connus pour leur diversification rapide. Les chercheurs ont observé l'émergence de nouvelles couleurs et motifs chez ces poissons, résultant de mutations et recombinaisons génétiques. Ces nouvelles caractéristiques jouent un rôle clé dans la sélection sexuelle et la spéciation.

L'évolution des enzymes chez les mouches de fruits (Drosophila melanogaster) :
Des mouches de fruits ont évolué en laboratoire pour métaboliser de nouvelles sources alimentaires. Par exemple, des populations de Drosophila ont été élevées sur un régime de maltose, ce qui a conduit à l'émergence de nouvelles activités enzymatiques spécifiques au métabolisme de ce sucre, démontrant l'apparition de nouvelles fonctions biochimiques.

L'émergence de la résistance à la déshydratation chez les scarabées :
Des études sur les scarabées Tribolium castaneum ont montré l'évolution de la résistance à la déshydratation en réponse à des environnements arides. Les scarabées ont développé des adaptations physiologiques et morphologiques, comme des changements dans la cuticule, qui leur permettent de mieux retenir l'eau.

L'apparition de nouvelles structures chez les plantes :
Dans certaines expériences de sélection artificielle, les chercheurs ont observé l'émergence de nouvelles structures chez les plantes. Par exemple, des croisements sélectifs de maïs ont conduit à l'apparition de nouvelles structures florales et de nouveaux types de grains, illustrant l'apparition de caractéristiques morphologiques inédites.