En même temps, tout est toujours organisé de façon stupide avec les golems

Mis à part quelques logiciels open source qui remplissent bien leurs fonctions, le reste (open source) est presque toujours merdique

Les seuls logiciels efficaces et fonctionnels pour l'analyse clinique sont presque toujours des logiciels propriétaires

La DB de ClinVar, du n'importe quoi d'ailleurs, n'importe quel golem peut soumettre des variants comme étant pathogénique, résultat des variants très fréquents sont classés comme pathogénique, généralement, les preuves pour la classification sont ridiculement faibles voire inexistantes à ce stade, mais ça n'empêche pas la soumission

D'ailleurs, cette vision des choses, où un variant peut être classifié seulement pathogénique / non pathogénique, et ses dérivés, est totalement stupide

Parfois, le paper à l'origine de la soumission n'est même pas cité et il faut faire des recherches avec le nom des auteurs et des mots clé, pour trouver la source, et ensuite, il faut encore faire un long travail d'analyse sur les variants, les soumissions ClinVar se limitent au strict minimum, c'est de la merde

Les annotations sont merdiques aussi

Surtout, développez vos propres logiciels pour la bioinformatique, ne comptez pas sur ceux des golems (quand vous arrivez à les lancer), ils sont bien souvent inefficaces. Il y a une poignée de logiciels open source que vous pouvez utiliser et qui fonctionnent plus ou moins bien, pour des fonctions basiques : SnpEff, GATK, IGV, SAMtools... et vous pouvez ensuite utiliser ces sorties de données pour une analyse plus approfondie avec vos propres logiciels. Car sinon, c'est des solutions propriétaires à la con, comme VarSome.

up

+ Plein d'autres trucs, t'as aussi oublié l'informatique de façon générale
C'est pas nouveau la bioinformatique

Ah ouais ! Le nouveau Aristote ! Le nouveau Leibnitz !

C'est dommage que pourtant tu n'en fasses rien et que tu sois probablement sous perfusion de l'état chez toi

ton h index fils de pute ?
allez ferme bien ta gueule maintenant

Tu n'as pas à énoncer de telles choses, khey

saliax

les revues prédatrices ca compte pas enculé de tes morts

Je ne parle pas des revues prédatrices le golem (qui sont eux aussi généralement des arnaques), je parle de grands éditeurs comme Elsevier, tu ne sais même pas comment fonctionne leur modèle stupide

Je ne veux pas publier dans tes revues, le golem, jamais je ne supporterai ce modèle stupide