Le préservatif ne couvre pas toute la région génitale. Des infections de la peau comme les mycoses ou des infections bactériennes peuvent se transmettre par contact peau à peau (zones non couvertes par le préservatif). Par exemple, une candidose (infection à levure) peut provoquer une irritation même si un préservatif est utilisé.
Certaines infections sexuellement transmissibles (IST), comme l'herpès ou les verrues génitales (HPV), peuvent parfois se transmettre par simple contact avec les zones non couvertes.
Faible protection contre les infections urinaires :

Le préservatif n'empêche pas forcément le développement d'une infection urinaire si certaines bactéries présentes à l'extérieur ou lors du rapport pénètrent dans l'urètre.
Mauvaise utilisation ou rupture :

Si le préservatif n'a pas été utilisé correctement ou s'il s'est déchiré ou déplacé pendant le rapport, il pourrait y avoir eu un contact avec des fluides ou des bactéries, augmentant le risque d'infection.

Allergie au latex : Si le préservatif était en latex, Les préservatifs en latex peuvent causer des irritations et des rougeurs si quelqu'un est sensible à cette matière.