La doctrine chrétienne traditionnelle n'a jamais considéré Marie comme faisant partie de la Trinité. Le Coran, cependant, semble suggérer cela, amenant beaucoup à conclure que Mahomet aurait mal compris la doctrine chrétienne.

Et voici ! Allah dira : "Ô Jésus, fils de Marie ! As-tu dit aux hommes : "Adorez-moi ainsi que ma mère comme des dieux, à l'exclusion d'Allah ?" Il dira : "Gloire à Toi !" "Gloire à Toi ! Je ne pourrais jamais dire ce que je n'avais pas le droit de dire. Si je l'avais dit, Tu l'aurais su. Tu sais ce qui est dans mon cœur, tandis que je ne sais pas ce qui est dans le Tien. En vérité, Tu es bien informé de tout ce qui est caché."
(Coran 5:116)

Cette formulation alternative de la Trinité est encore plus claire dans (Coran 5:72-75), où il n'est pas fait mention de l'Esprit Saint et où il est réfuté la divinité de Jésus et de sa mère en soulignant qu'ils mangeaient de la nourriture, comme des êtres humains normaux.

Ceux qui ne croient pas sont ceux qui disent : Allah est le Messie, fils de Marie. Le Messie a dit : Ô Enfants d'Israël ! Adorez Allah, mon Seigneur et votre Seigneur. Celui qui associe d'autres à Allah, Allah lui a interdit le Paradis. Son refuge sera le Feu. Pour les méchants, il n'y aura pas de secours. Ils ont certainement mécru, ceux qui disent : Allah est le troisième de trois, alors qu'il n'y a pas de divinité si ce n'est le Seul Allah. S'ils ne se détournent pas de cette parole, une calamité douloureuse frappera ceux d'entre eux qui ne croient pas. Ne voudraient-ils pas plutôt se tourner vers Allah et demander Son pardon ? En vérité, Allah est Pardonneur et Miséricordieux. Le Messie, fils de Marie, n'était qu'un messager parmi les messagers avant lui. Sa mère était une femme pieuse. Ils mangeaient tous deux de la nourriture terrestre. Vois comment Nous leur exposons les révélations et vois comme ils s'en détournent.
(Coran 5:72-75)